У меня точно такая же ситуация ..Я уже здесь выше писала ...
Я - гражданка Украины с неограниченным сроком пребывания в Германии, ребенку 3,5 года - он немецкий гражданин . Я специально не вписывала его в свой украинский загранпас ,соответственно он не имеет укр гражданства ,для того, чтобы не было проблем потом .... Летаем в Киев каждый год без нашего папы - гражданина Германии .... Также у нас с ребенком разные фамилии, у ребенка свой немецкий райзепас с фотографией, сделанной еще в годик ... Пока не меняли ....
Какие документы я вожу всегда с собой : для себя - только мой загранпас ,для ребенка - райзепас ,свидетельство о рождении и письменное разрешение отца на поездку ребенка вместе с мамой, набранное самостоятельно на компе и заверенное в ратхаузе . Все .... Я всегда предьявляю эти доки на пассконтроле на немецкой стороне.... Украинская сторона смотрит только паспорта ,и на въезде и на выезде ....