Вычитал о такой классификации бактерий (жена добавила, что есть и третья группа - лабильные), но в книжке 10-ти летней давности стояло, что до сих пор не выяснено, почему именно одни окрашиваются, а другие нет. Собственно вопрос: выяснили ли химическую подопл╦ку?
П.С. Про липополисахаридные слои знаю.

Насколько я помню (а изучал давно), свойство бактерий окрашиваться по методу Грамма связано с разницей в строении клеточной стенки. У грамм-положительный бактерий она намного толще и содержит большое количество муреина и тейхоевых кислот. С ними краска (не помню, что там применяется - давно было) и связывается. А когда их спиртом отмывают, то стенка слегка сжимается, что препятствует вымыванию краски. Кажется так. Если новый механизм открыли - я о нем не знаю....

Так оно и есть, но присутствие более толстой мембраны, скорее, признак, чем объяснение.

Не мембраны, а клеточной стенки. Это не тождественные понятия. Мембрана у тех и других одинаково тонкая и являет собой билипидный слой, как и у других клеток. Клеточная стенка располагается над мембраной с внешней стороны. Служит как для защиты бактериальной клетки от внешних воздействий, так и для предохранения бактерии от разбухания (у нее внутреннее давление выше наружного). За счет того, что стенка у положительных толще в 2-3 раза, там связывается достаточно красителя, чтобы это заметить. Никакого волшебства, чистая физика....

За счет того, что стенка у положительных толще в 2-3 раза, там связывается достаточно красителя, чтобы это заметить
Точно, но толще в 20 раз
Gram -
outer-membrane
Zellwand, 2-Schichtig
Innere Membran
Gram +
Zellwand, 40-Schichtig
Teichonsäuren
innere Membran

Поправка принята, но с натяжкой. Я не пояснил, какая мембрана. Цитирую учебник по углеводам (химический, не биологический, что, конечно, немного принижает точность):
"Хотя и существуют немногие исключения, бактерии с наружней липидосодержащей мембраной являются грам-негативными, а без не╦ - грам-позитивными". Извиняюсь за язык, свободный перевод с немецкого (на всякий случай, если все владеют немецким, буду приводить оригинальные цитаты). То есть, не имеется в виду цитоплазматическая мембрана с билипидным слоем.
НизачОт! Какое-то школьное объяснение. То есть, под более сильным микроскопом это вс╦ же было бы видно? И потом, что значит, связывается? Химическая реакция? Какая ж тут физика? Кстати, тейхоевые кислоты присутствуют только в позитивных. Может, из-за них?

outer membrane у грам-негтивных бактерий тоже билипидный слой.
грам-позитив: толстый слой пептидогликана теряет воду при воздействии этанола и становится непроницаемым для комплекса красителя с иодом (поры закрываются), который и остается или на пептидогликане или внутри клетки.

Это идея или подтвержд╦нный факт?

да, это факты. Механизмом Gram Staining занимались в последние 15-20 летпрошлого столетия. Хотя, наверно, остались ещенекоторые неясности.