В городе Мохенджо-Даро не было построено ни одного храма, поэтому нельзя сказать, каким богам поклонялись жители города. Но некоторые ключи к разрешению этого вопроса все же есть. Это, например, каменные отпечатки (рельефные таблички), которые были обнаружены в Мохенджо-Даро и в другом месте в долине Инда, в Хараппе. Археологи решили, что эти отпечатки были предметами торговли. Многие отпечатки были квадратной формы, наверху их пересекает надпись в виде непонятных значков, а внизу резьба, которая часто представляла собой силуэты животных. К сожалению, надпись не содержит достаточное количество различных букв, так что археологи не смогли расшифровать язык жителей долины Инда. Среди животных, изображенных на табличке, были тигры, носороги, крокодилы и слоны. Но чаще всего изображался брахман-бык с горбом, длинными рогами и большими складками кожи на горле. Именно эта порода быков считается священной среди современных индусов. Археологи считают, что этот факт позволяет предположить, что в долине Инда зарождался индуизм.
Большое здание бани на цитадели в Мохенджо-Даро - это другой ключ к гипотезе, что религия жителей долины Инда была во многом похожа на современный индуизм. Расположение здания бани на таком видном месте позволяет предположить, что оно использовалось с религиозными целями. Похоже на то, что банный ритуал в долине Инда представлял собой религиозную церемонию, точно так же, как это практикуется среди современных индусов. Индивидуальные банные комнаты были отгорожены от главного бассейна, который, возможно, использовался духовными служителями, жившими в комнатах, расположенных наверху здания.
Статуя, обнаруженная в Мохенджо-Даро, может дать нам представление о том, как выглядели тогдашние священники. Она имеет 18 см (7 дюймов) в высоту и представляет собой бородатого мужчину, глаза которого полузакрыты так, словно он молится. Его плащ покрыт орнаментом в виде трилистников или листочков клевера, что довольно часто встречается на культовых скульптурах, найденных среди остатков древних цивилизаций в Египте и Месопотамии.