Скорость
Допустим, объект движется очень быстро - намного быстрее земных самолетов. И были случаи, когда НЛО легко уходили от погони истребителей. А радиолокатор не рассчитан на такую стремительность. И попросту не можетвыдать информацию оскорости и размерах объекта.
Не видят, потому что не хотят
И, наконец, самое реальное объяснение: оборудование современных радиолокаторов обрабатывает полученную информацию автоматически. И только потом она попадает оператору. Но если фиксировать, допустим, каждую стаю птиц в зоне действия РЛС, то можно утонуть в информации. Поэтому компьютеры ПВО фильтруют данные локаторов, отбрасывая, по их "мнению", то, что не может быть самолетом или ракетой вероятного противника.
Засекли!
Но все же иногда НЛО попадают в поле зрения военных.

"...В 1989 году три из пяти радиолокационных станций в графстве Ланкшир на высоте 15 километров одновременно засекли объект размером около полусотни метров. На экранах он появился внезапно, как будто бы "сдернул шапку-невидимку". По тревоге было поднято звено истребителей. Но объект начал подниматься. И через шесть минут станции слежения его потеряли..."
Самый же известный случай наблюдения НЛО, по мнению экспертов,произошел в районе базы британских ВВС в Нетсхеде. По счастливой случайности в момент, когда локатор ╚нащупал╩ НЛО, поблизости находился самолет королевских ВВС. Летчик сумел сблизиться с объектом и описал его так: "Это треугольный объект, его размеры я оценил визуально в несколько десятков метров. При приближении моего самолета объект в течение двух секунд опустился с высоты 20 километров всего до трех. Повторить его маневр я технически не мог. Оно от меня ускользнуло..."


(Из доклада "Неопознанные воздушные явления в зоне действия британских ВВС".)