Вспомни классику - как читал Филипок :-) он же тоже называл побуквенно, а потом складывал в слог. Это, конечно, не совсем то, что ты описываешь, но причина, я думаю, та же: мы учим сначала буквы, а потом слоги. Выделение первой буквы - это этап дешифровки. Наверное, в абсолютном большинстве случаев с практикой это действительно уходит. Но вообще почти все методисты пишут, то побуквенного чтения следует избегать - во многих пособиях слоги выделяются дугами, чтобы облегчить эту задачу. Я тоже эти дуги всегда рисую карандашом, если в букваре/в тексте их нет. Е.Агеева вообще уже в первых уроках (с появлением прямых слогов) подчеркивает, что важно учить видеть слог целиком и читать слог слитно, для этого у нее есть ряд упражнений. Например, ребенок не читает слоги, а находит (озвучиваешь ты). Здесь чтение пассивное, но тем не менее, в слуховую зону попадает правильный вариант. Еще у нее есть хорошее упражнение - комплементарное чтение. Это когда ты читаешь (произносишь) фразу, в которой есть рифма на прямой слог и просишь ребенка прочитать только этот слог. В этом случае ребенок опирается на рифму и автоматически читает правильно - слитно. Сейчас покажу пример. Надеюсь, авторских прав я не нарушаю, на всякий случай еще раз ссылка на этот букварь :-)

Говорим на двух языках.