В общем, этот Президент сломался, несите нового! )

Если честно, полагаю всё несколько прозаичнее. Всё нижеизложенное - чисто гипотезы, лично с кухней АПУ не сталкивался.

С учетом того, что документы из МИДа приходят "полуфабрикатом", т.е. с проверками по всем инстанциям, то обработкой их в АПУ, скорее всего, занимается 2, от силы 3 человека.

1 или 2 из этих 3 гипотетически могут: уйти в декрет, заболеть, уволиться итп. Или поймать вирус в приложении к письму (как вариант) и потерять месячные результаты работы (в зависимости от стандартов IT в АПУ).

С учетом длительной задержки, эти же люди часть рабочего дня потихоньку закипая отвечают на запросы (в т.ч. телефонные).

Если "окно" указа прошло (указы, поди, генерирует и проверяет кто-то еще по своему расписанию), то вижу 2 варианта:

- оптимистичный: в теории комиссии проводятся раз в 2 месяца, результаты обеих комиссий слепят в один указ;

- пессимистичный: следующая комиссия проводится после подписания результатов прошлой, указ по непонятной причине сдвигается;

Президенту лично, думаю, указы о выходе из гражданства (кроме одиозных случаев), даже не в первой 20ке приоритетов - тема слишком узкоспециальная, хоть и чувствительная для причастных.

В общем, я склоняюсь к временной технической накладке.